Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cops6O88545 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cops6O88545 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cops6O88545 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cops6O88545 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cops6O88545 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cops6O88545 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cops6O88545 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cops6O88545 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cops6O88545 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cops6O88545 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cops6O88545 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cops6O88545 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cops6O88545 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cops6O88545 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms