Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmx1O70218 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmx1O70218 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmx1O70218 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms