Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkbO55229 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkbO55229 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkbO55229 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkbO55229 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkbO55229 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkbO55229 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ChkbO55229 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkbO55229 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkbO55229 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkbO55229 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChkbO55229 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkbO55229 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChkbO55229 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChkbO55229 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms