Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Banf1O54962 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Banf1O54962 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Banf1O54962 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Banf1O54962 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Banf1O54962 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Banf1O54962 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Banf1O54962 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Banf1O54962 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Banf1O54962 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Banf1O54962 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Banf1O54962 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Banf1O54962 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms