Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole2O54956 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole2O54956 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole2O54956 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole2O54956 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole2O54956 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole2O54956 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole2O54956 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole2O54956 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole2O54956 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole2O54956 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms