Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops5O35864 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops5O35864 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops5O35864 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops5O35864 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops5O35864 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops5O35864 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops5O35864 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cops5O35864 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cops5O35864 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops5O35864 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops5O35864 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops5O35864 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cops5O35864 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops5O35864 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.4 ms