Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppef2O35385 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppef2O35385 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ppef2O35385 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms