Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pitx3O35160 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx3O35160 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx3O35160 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms