Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq2O09161 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq2O09161 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq2O09161 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq2O09161 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq2O09161 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq2O09161 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq2O09161 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq2O09161 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq2O09161 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq2O09161 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq2O09161 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq2O09161 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq2O09161 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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