Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm29394H3BIW7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29394H3BIW7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29394H3BIW7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.5 ms