Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ScaperF8VQ70 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ScaperF8VQ70 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ScaperF8VQ70 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms