Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5160F8VPN3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5160F8VPN3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms