Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdh11xF6ZNL5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh11xF6ZNL5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh11xF6ZNL5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh11xF6ZNL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms