Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20538F6Z9R1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20538F6Z9R1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms