Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm8005F6YKY3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm8005F6YKY3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8005F6YKY3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm8005F6YKY3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms