Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm21970F6XX07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm21970F6XX07 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm21970F6XX07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm21970F6XX07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm21970F6XX07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm21970F6XX07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm21970F6XX07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21970F6XX07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21970F6XX07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm21970F6XX07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21970F6XX07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21970F6XX07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gm21970F6XX07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21970F6XX07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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