Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Pcdhb9E9Q5G2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcdhb9E9Q5G2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdhb9E9Q5G2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pcdhb9E9Q5G2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcdhb9E9Q5G2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms