Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd1E9Q3H4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Susd1E9Q3H4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms