Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim30dE9PWL0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trim30dE9PWL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim30dE9PWL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30dE9PWL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms