Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf217D3YYI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf217D3YYI7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf217D3YYI7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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