Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn24D3YXJ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn24D3YXJ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn24D3YXJ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms