Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms