Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20547B8JJN0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20547B8JJN0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20547B8JJN0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20547B8JJN0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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