Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71aB7XG49 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71aB7XG49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam71aB7XG49 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam71aB7XG49 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms