Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbb-bh2B2RVB7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms