Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan5bB2RTN3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan5bB2RTN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan5bB2RTN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan5bB2RTN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan5bB2RTN3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zscan5bB2RTN3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan5bB2RTN3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan5bB2RTN3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan5bB2RTN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms