Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn8B1ARD8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn8B1ARD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms