Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1L1SQF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1L1SQF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1L1SQF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1L1SQF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1L1SQF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1L1SQF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms