Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms