Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K4

Trav19, T cell receptor alpha variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav19A0A0B4J1K4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trav19A0A0B4J1K4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trav19A0A0B4J1K4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,67■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16,67■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16,66■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Trav19A0A0B4J1K4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,26
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