Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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