Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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