Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQQ0

Gm28557, Predicted gene 28557, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28557A0A087WQQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28557A0A087WQQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28557A0A087WQQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28557A0A087WQQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28557A0A087WQQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28557A0A087WQQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Gm28557A0A087WQQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28557A0A087WQQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28557A0A087WQQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28557A0A087WQQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28557A0A087WQQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28557A0A087WQQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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