Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.5 ms