Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms