Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms