Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Krt27Q9Z320 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Krt27Q9Z320 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Krt27Q9Z320 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Krt27Q9Z320 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Krt27Q9Z320 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Krt27Q9Z320 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms