Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt16Q9Z2K1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms