Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Robo3Q9Z2I4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Robo3Q9Z2I4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms