Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgr5Q9Z1P4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms