Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup160Q9Z0W3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms