Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cldn13Q9Z0S4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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