Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms