Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn3Q9Z0G9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms