Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AireQ9Z0E3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms