Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx1Q9WV80 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms