Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VapaQ9WV55 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VapaQ9WV55 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VapaQ9WV55 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapaQ9WV55 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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