Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms