Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv2Q9WTR1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms