Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec4eQ9R0Q8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec4eQ9R0Q8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms