Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms